Orientació¶
Traducció assistida per IA - més informació i suggeriments
Aquesta orientació assumeix que ja heu obert l'entorn de formació fent clic al botó "Open in GitHub Codespaces". Si no ho heu fet, feu-ho ara, idealment en una segona finestra o pestanya del navegador perquè pugueu consultar aquestes instruccions.
Requisit de mida de màquina
Assegureu-vos de seleccionar una màquina de 8 nuclis quan creeu el vostre Codespace per a aquest curs de formació. Els workflows de bioimatge requereixen recursos de càlcul addicionals.
GitHub Codespaces¶
L'entorn de GitHub Codespaces conté tot el programari, codi i dades necessaris per treballar en aquest curs de formació, així que no cal que instal·leu res vosaltres mateixos. No obstant això, necessiteu un compte de GitHub (gratuït) per iniciar sessió, i si no esteu familiaritzats amb la interfície, hauríeu de dedicar uns minuts a familiaritzar-vos-hi completant el mini-curs d'Orientació de GitHub Codespaces.
Pre-descàrrega d'imatges Docker¶
Un cop hàgiu obert el vostre Codespace, descarreguem totes les imatges Docker que necessitarem per a aquest curs de formació. Això estalviarà temps més endavant i garantirà una execució fluida dels workflows.
Obriu una nova pestanya de terminal i executeu la comanda següent:
Aquesta comanda descarregarà totes les imatges Docker necessàries en segon pla. Podeu continuar amb la resta de l'orientació mentre s'executa.
Tip
La bandera -stub permet que el pipeline s'executi ràpidament sense processar dades reals, cosa que és perfecta per descarregar imatges. Podeu monitoritzar el progrés a la pestanya del terminal.
Directori de treball¶
Al llarg d'aquest curs de formació, treballarem al directori nf4-science/imaging/.
Canvieu de directori ara executant aquesta comanda al terminal:
Tip
Si per qualsevol motiu sortiu d'aquest directori, sempre podeu utilitzar el camí complet per tornar-hi, assumint que esteu executant això dins de l'entorn de formació de GitHub Codespaces:
Ara, per començar el curs, feu clic a la fletxa de la cantonada inferior dreta d'aquesta pàgina.